哈医大二院栗玉珍教授团队发布整合银屑病人皮肤单细胞图谱在线工具为银屑病发病机制的核心调控机制提供新的见解
近日，哈尔滨医科大学附属第二医院皮肤科主任栗玉珍教授团队在Front Immunol（IF=8.7）杂志发表题为Integrative single-cell transcriptomic investigation unveils long non-coding RNAs associated with localized cellular inflammation in psoriasis的文章。该研究提供了一个全面的健康和银屑病条件下的全层人类皮肤的细胞转录组及LncRNA图谱，揭示了控制银屑病局部细胞炎症的一种新的调控机制，并突出了LncRNA在银屑病中的治疗潜力。
栗玉珍教授带领科研团队进行讨论
哈医大二院皮肤科高雨歌为该论文的第一作者，哈医大二院博士生那梦雪为共同第一作者，哈医大二院李超、李里、杨光宇为共同作者。哈医大二院皮肤科栗玉珍、瑞典卡罗林斯卡医学院胡益洲为共同通讯作者。
栗玉珍教授介绍，在这项研究中，使用了神经网络学习管道，整合了来自健康人类皮肤的106,675个细胞和来自银屑病人类皮肤的79,887个细胞，构建了目前世界上最大的银屑病皮肤细胞图谱数据集。本数据集可以进行公开访问，具有在线获得所有细胞亚群中不同基因表达/共表达情况及数据可视化等功能。此外，本研究还率先利用整个皮肤组织的单细胞转录组学来精确定位在细胞水平上调节银屑病局部炎症的LncRNAs。分析了从银屑病病变和健康皮肤中分离出来的单个细胞的转录组，鉴定了参与局部炎症的新的差异表达的LncRNAs。研究为银屑病发病机制的核心调控机制提供了新的见解，并强调了单细胞转录组学在识别疾病相关细胞群和分子靶点方面的重要角色。同时在线图谱工具为后续皮肤细胞亚群研究人员提供便利，直观的可视化结果对生信基础较弱的临床医学研究人员非常友好，希望能够助力皮肤科研。（田为 曹玥 高雨歌）
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